Морски музей се намира на територията на старото пристанище на Сунда Келапа. Сунда Келапа с сунданского език се превежда като "кокос Сунда" - този порт е главно пристанище на кралство Сунда, която е съществувала в западната част на остров Ява от 669 г. до 1579 година. Кралство Сунда охватывало територията на сегашните провинции Бантен, Западна Ява, столицата Джакарта и западната част на провинция Централна Ява. Заслужава да се отбележи, че на пристанището играе важна роля в развитието на столицата на Индонезия, Джакарта.

Откриването на морски музей се състоя през 1977 година. Морският музей на Джакарта се помещава в бивш склад на Източно-Индийската компания, която е участвала наред с други неща, подправки и хранила ги на склад. Посещение на Морския музей, посетителите могат да научат интересни факти за морската история на Индонезия, за традициите на мореплаването, както и да открият за себе си - колко голямо значение има море за икономиката на Индонезия днес.

В музея са представени модели на рибарски лодки и на традиционните ветроходни кораби в пълен размер от всички краища на Малайския архипелаг. За да можете да видите и военно-морски карти Индонезия, различни навигационни средства, снимки и др. Посетителите могат да видят рядка колекция от най-известните шхун "пиниси" – традиционни индонезийски двухмачтовых ветроходни кораби, които се ползват от бугисы – една от най-големите етнически групи в провинция Южен Сулавеси. Тази провинция - третата по големина в Индонезия. Представена е и модел на лодка, която е била използвана още в епохата на империята Majapahit. Има отделна зала, в която може да се види богата колекция от флората и фауната на Индонезия.