Ираклион е построена от арабите през IX век. Тогава това се нарича Хандакас. В средновековието венеция обнесли град стена с дължина 5 км. На малък площад в центъра на града се намира красивата мраморна чешма, наречена в чест на венецианския пълководец Morosini. Също остана няколко венециански къщи.

Гордост на града е най-богатият Археологически музей. Тук са събрани всички най-значимите експонати на Минойската култура: керамика, каменна резба, издълбани печат, скулптура, златни бижута, изделия от метал, прекрасни стенописи от дворци и богати имения, както и уникален каменен саркофаг от Aghii Триада.

Исторически музей в града представя експонати от византийски, венециански и турски периоди и исторически документи от най-новата история на Крит. Тук също са представени местни народни костюми, тъкани изделия, дърворезба, бродерия и други предмети на декоративно-приложното изкуство.