В Япония има два храма с името на Кофуку-дзи – един от тях се намира в Наре, а вторият – в Нагасаки. Храмът, разположен в Нагасаки, е един от "манастири на щастието", заедно с Фукусай-джи, Софуку-дзи и Сефуку-дзи. Всички те са построени от китайските монаси през първата половина на XVII век.

Храм Кофуку-джи е построен през 1624 г. и е най-старият будистки манастир от тези, които са били построени представители на китайската диаспора Нагасаки. Принадлежи на будистката училище Обаку потока на дзен.

На пристанището на град Нагасаки в продължение на дълго време остана единственият морски "врата" в Япония, които са били отворени за чуждестранни кораби. Голяма част от търговците е дошла в това число и от съседен Китай. През 1620 г. те се обърнаха към градски главата Нагасаки с прошением за изграждането на малък манастир, в който гражданите на Китай биха могли да се обърнат към божества, с молитвите и молбите за покровительстве в опасни морски пътешествия. В това време японските власти вече са започнали гоненията на християните и са станали особено за насърчаване на изграждането на будистки и синтоистских храмове. Така че китайските търговци са получили разрешително и са доказали своята непричастность към християнството.

Особено въздействие манастир Кофуку-джи, придобити през 1654 г., когато настоятел станал майстор на дзен Инген, пристигнали от Китай. Над входа в храма виси лачена плоча с йероглифи, написани от ръката му.

Манастирът се намира в район, който се нарича Терамати - Храмов редица или Храмов град, където се намират много храмове Нагасаки. Храмов комплекс, построен в китайски стил епохата на династията Мин, му се отличава с много архитектурни детайли, както и специален цвят на стени, наречен "китайското червено."

Основната сграда на храма – Дайо Хондэн е построена през 1632 г., но съвременните посетители могат да видят след три реконструкции, последната от които е минал през 1883 година. В олтара на храма са монтирани статуя на Буда Шакямуни и божества Каннон и Дзидзо. В ляво от основната сграда се намира Масо-до зала богинята на Мадзу (или Матца), покровител на моряците. В Масо-до моряците са оставени на временно съхранение на преносими олтари, които са взимали със себе си в плуване. Сградата Масо-до реконструкция 1670 г. – най-старото в храмовом комплекс.

Кофуку-дзи не са засегнати от ядрен взрив през 1945 г., но почти не е останал без енориаши след Втората световна война, тъй като много китайци са напуснали Япония.