Е построена в 1590-1592 година пазач на Еврейския град Мордехаем Майзлом, който финансира широка преструктуриране на гето в стил Ренассанс. Синагогата е построена под ръководството на Йозеф вала и Юда Голдшмида де Херца. Оригиналната сграда е претърпял големи щети по време на пожар 1689 г., след което сградата е била възстановена в Бароков стил. След корекция в нео-готически стил по проект на А. Гротта в 1893-1905 година синагога до голяма степен е загубила черти на Барока. От първоначалната разпореждане в Ренесансов стил е запазена трикорабна разпределение на главния главини и надстроенные женски галерии.

В момента Майзелова синагога служи като изложбен помещения и складове на Еврейския музей. В първата част на шоуто История на евреите в Бохемия и Моравия със заселването до началото на еманципацията илюстрира хода на историята на евреите в Чешките земи от Х век до края на XVIII век. Уводна част запознава с историческите данни за произхода на еврейски селища в Бохемия и Моравия. Както и с правни и социално положение на еврееев в средновековна държава. Обръща се специално внимание на епохата на Възраждането, свързани с изграждането на синагоги, така и с името на техния основател Мордыхая Майзла. Традиционната еврейската просвещенность представляват произведения на видни учени, които са заемали мястото на равините и ректорите талмудических училища в чешки и моравски еврейски общности (rebbe Liwa, Дейвид Опенхайм).