Музей на историята на Рига и навигация се намира в Стария Рига, в перестроенном бивш катедралата дуомо. Това е не само най-старият музей в Латвия, но и в Европа.

Произходът на създаване на музей датират от 18 век. В основата на богатите фондове се помещава колекция от експонати лекар Рига Николауса фон Химзеля (1729-1764). След смъртта на Николауса, майка му, според волята на сина си, дарени експонати, сред които са били естественнонаучные, художествени, както и на исторически предмети, дарени на Рига. Рижские владетели през февруари 1773 година са дали указания да се основе музей, определяйки го като име Химзеля. Тогава музеят се помещава в закрито Анатомични театър, кораби на ул Калею 34/36. До наши дни тази сграда, за съжаление, не е запазена.

През 1791 г. музеят се премества в източно крило на катедралата дуомо, специално оборудвано за нуждите на музей и градската библиотека. През 1816 г. в музея е открит кабинет изкуства, а в края на 19 век – монетен кабинет. Развитието на музея, свързани с дейността на различни общества, колекции, които са представени в музея в 1858 година. През 1890 г. дружество, които са участвали в живота на музея (дружество за изучаване на историята и антики Прибалтийских провинции на Русия, Литературни практически съюз на гражданите и други) се премества, заедно с колекции, в Рени ансамбъл, в който за нуждите на музея са изградили сграда по ул Паласта, 4.

През 1932 г. Рени музей, включително и от наличните колекции, се присъедини към списъка на обекти за Управление на паметници на Латвийската Република, но по-късно четири години е бил затворен. Едновременно управление на градската града създава Рига-градския исторически музей. Развитие на новосъздадения музей е била спряна във връзка с която започна Втората Световна война, а по-късно му пречи на съветската окупация. За целия този труден период, който не веднъж е сменял името, като се започне от 1964 г. и до ден днешен, той се нарича музей на историята на Рига и навигация.

През 2005 г. Музей на историята на Рига и навигация е преобразувана в Държавна агенция. Към днешна дата в музея се съхраняват повече от половин милион теми, разделени в 80 колекции. Най-значими колекции има археологическа и нумизматична. В състава на музея 3 филиала – Къща Менцендорфа в Рига, Музей на Фотографията и Музея на Латвия Айнажского мореходного училище.