Базилика, издигната още Константин, е била подложена на набези и грабежи вандалите Генмерика, е силно засегната от земетресение 896 г. и многобройни пожари. В продължение на векове тя не веднъж възстановен и реставрировалась с участието на такива архитекти, като Джовани ди Стефано, Франческо Боромини и Алесандро Галилея, който през 1735 г. напълно перестроил фасада.

Базилика на Сан Джовани ин Латерано - това е мощна архитектурна структура монументална коринтски поръчки. Няколко стърчащи напред централната сграда е украсена с оградата, която съживява целия катедралата, придава ярко изразена барочную цвят. Над оградата се издигат колосални статуи на Христос, Йоан Кръстител, Йоан Евангелист и Учители на Църквата. В църквата са пет входа с тераси над тях. Последно влизане от дясно е известен под името Пристанището на Санта (светия Gate) и се използва само по църковни празници.

Основната част на църквата датира от 1589 година, но някои сгради са оцелели от по-древни времена, например, Скала Санта (Свещената стълба), която Христос е възкръснал в съда на Пилат.

Величествен интериор представлява по отношение на латински кръст с пет трикорабна. Луксозен таван вероятно е расписан Pirro Лигорио. Покрай стените отиват статуи на Пророци, Светии и Апостоли, направени по скици на Боромини учениците му в XVIII век. Там, където интериорът на катедралата се пресича с трансептом, се намира сърцето на готическата катедрала - табернакль, направен от Джовани ди Стефано. В папския олтар се съхранява безценната реликва - груба дървена дъска, служещо на Св.Петър за извършване на обреда на богослужението в катакомби.