Обиколка на парка Уено непременно ще доведе гости в японската столица в Националния музей на природата и науката, разположен в северо-източната част на парка. Неговата експозиция има над 14 хиляди експоната и разказва за произхода на света като цяло и на Японския архипелаг в частност, както и за онези промени, които са настъпили в техните истории от момента на възникване до наши дни.

Музеят е открит през 1871 г. и от тогава смених няколко заглавия – той е и музей на Министерството на образованието и Токийским музей, докато през 2007 г. не е придобило сегашното си име. В края на ХХ и началото на този век, музей издържа модернизация. Основната му сграда е обявено за културно наследство на нацията, в него сега се помещава Японската галерия, тук също се намира в 3D-кино "Драма 360". В нова луксозна сграда на музея е отворена Глобална галерия. Преди да влезе в музей поставена фигура на синия кит в пълен размер.

Шест етажа Глобалната галерии разказва за еволюцията на живота на земята, закони на природата, произхода на динозаврите и изгледа разнообразие. Отделни раздели са посветени на развитието на науката и технологиите и представители на животинския свят. В градина, разположена на покрива на галерията, растат около 160 вида лекарства и билки, и са слънчеви чадъри, които се разкриват при приближаване на човек до тях. В галерията посетителите могат сами да прекара физическия опит или да влязат в интерактивен гора.

Японската галерия се помещава в бивш основната сграда, датираща от 1930 година. Тук е показано, как е на Японски архипелаг по време на Ледниковия период, могат да разгледат колекции от минерали, метеорити, древни изкопаеми, за да се запознаят с животните, населяющими острови на архипелага, за да разберете, кои са били сельхозорудия. Отделен раздел е посветен на ролята на ориз в живота на Япония.

3D-кино "Драма 360", който се намира в същата сграда, били предадени на музея след края на международната изложба "Експо-2005", където за първи път са представени на посетителите на павилиона на Япония. Това е сферична, безшевни екран с диаметър 12, 8 метра. Този размер е избран случайно: тази цифра – около една милионна част от диаметъра на нашата планета. Цифрата на 360 в заглавието кино означава зрителен ъгъл. Зрителите в този киносалон, разположени в центъра на сфера, а на нейния купол се проектират филми за произхода на Вселената, динозаври и материках. Четири от тях са създадени от служителите на музея.