Църквата Ла Матриз се намира в град Валпарайсо, в сърцето на района на пристанището, така наречените историческия център на града, заобиколен от калдъръмени улички и къщи от края на XIX век.

Първата сграда на църквата е построена на това място в 1559 г. под формата на скромен параклис за жителите на малко селце и екипажи на кораби, останавливающихся редовно в пристанището на Валпарайсо. Нейните стени са направени от недозрял тухли, покрити с сламен покрив. В 1578 г., сградата на храма, беше изгорен от пиратите Франсис Дрейк. През 1620 г. на това място е построен нов храм, освященный в чест на Богородица, чийто образ се появява в герба на града. Вътре в църквата се е намирало изображение на Христос, изпратен в Сантяго краля на Испания Филип II през 1630 г., който по погрешка се озова в тази църква.

Сградата на църквата отново е силно повреден и впоследствие възстановена след опустошителното цунами 1730 година. През 1822 г., след поредната земетресение било решено да започне ново строителство, което привлече в града на голям брой заможни семейства и увеличава обема на градското планиране в Валпараисо.

Изграждането на тази църква е започнало през 1837 година и е завършен през 1842 г. под ръководството на свещеник Хосе Антонио Риобио. Църквата е трикорабна, с три и правоъгълно простора, увенчана с осмоъгълна кула с spire и се откроява с хармоничен с лицева фасада. Осем колони обграждат кула, където са ранените. Вътре в църквата е трикорабна разделени арки, стените са от дърво и са украсени с фрески и корнизи.

Стил класицизъм ясно се вижда на фасадата и купола на църквата. Във всичко останало - в големи, дебели глинени стени и островърх покрив - присъства креолски стил XVIII век.

През 1900 г. Валпарайсо е посветен на Пресвятому Сърцето на Исус, което олицетворява тържествена статуя на дълга площад пред църквата Ла Матриз. През последния век църквата на няколко пъти ремонтировалась след земетресенията, 1971 и 1985 година. След последното земетресение през февруари 2010 г. са проведени нови реставрационни работи през 2012 година. Затова църквата Ла Матриз днес е в добро състояние.

Църквата Ла Матриз е обявена за национален паметник на Чили през 1971 година.