В близост до Гергьовден манастир, при изворите на Volkhov в изключително живописна местност се намира Перынский обителта на Рождество Богородично. На това място в дохристианское време и е разположена капище "Перун", която се споменава още от 6-ти век. В 989 г. град Новгород е кръстен на епископ Иоакимом Корсунянином. След това капище е било разрушено, а направена от дърво статуя на бог Перун е паднала в реката. Епископ през 995 г. беше направена тук църквата е в чест на Рождество Богородично, която се е намирала тук повече от 200 години, но за нея почти нищо не е известно. Най-вероятно, по това време е бил създаден манастирът, но първите летописи се споменава за него само в 1386 г.: той беше в списъка на манастири, които са били изгорени новгородцами при приближаване на войски на княз Дмитрий Донски.

Появата на камък на храма Рождество Богородично се отнася до 30-та година от 13-ти век. В основата на сградата, дошедшего до нас, е, зидария още домонгольского време, което е комбинация от тънки тухли и варовик – това е плинфы, които са били изложени на варовик разтвор, в който е добавена тухлена едно бебе.

Коронясване на църквата кръст е представен накупольным с полумесец, което е характерно за домонгольского време. Известно е, че полумесец, разположен под кръста, по произход е стилизирани лозови лози и съвсем не е без значение за символическому образ на исляма, въпреки че има много християнски тълкувания.

В Перынском манастира през 1528 г. е била построена дървена трапезария и църквата света Троица. В това време, когато е излязла на шведската окупация в 1611-1617 г., манастирът е бил ограбен и опожарен. В подкрепа на запустевшей църквата през 1634 г. тя е се дължи на царска ограмотяване на Свето-Юрьеву манастира.

През 1764 г. при Екатерина II проведе църковно-поземлената реформа. Според реформата на всички църковни земи са били предадени в ръцете на държавата, както и голяма част от манастирите са просто затворени. Общо 953 манастир, от тях беше останало само 224 в щата, както 161 за персонал, т.е. в съдържанието си. Броят на монасите е намалял повече от два пъти и възлиза на около 5 хиляди. Приходите на църквата е паднал почти три пъти. При това, Перынский манастир е бил премахнати, а неговата църква е била изработена в енорийската; всички сгради са били разглобена и разположени в Свето-Гергьовден манастир.

Възраждане Перынского на манастира се свързва с името на архимандрит Фотия. Като иеромонахом в санкт Петербург, Фотий бил категорично не съм съгласен и е действал срещу образованите слоеве на населението, мистика, а също и учението, което проповедовало общение на човека с Бога, без участие на Църквата и нейните обреди. За този вид дейност Фотия се прехвърлят в Новгород през 1821 година. През 1822 г. Фотий е бил назначен на пост архимандрит Свето-Гергьовден на манастира, което и остава до смъртта си. С помощта на огромни средства своята добра позната Анна Орлова-Чесменской той успя да направи истинско жилище. Скоро църквата Рождество Богородично са възложени на Свето-Юрьеву манастира. Външни и вътрешни стени на храма са били ремонтирани и отново подлежали стенописи, а от западната страна е била направена обширна постройка, направена глава и ремонтират подови настилки. След като е завършен ремонт, в 1828 г., църквата е била осветена.

През 1941-1945 г. в района на Перынского обител се проведе на предната линия, а на територията му са били окупирани. През 1951-1952 г. са били направени археологически разкопки, начело с Арциховским А. В.; в това време са били открити следи от древния капища. Последните реставрационни работи чакали Перынскую църква в 1962-1965 година.

През 1991 г. цялата Перынский полуостров с постройки и храмове бил предаден в ръцете на Руската Православна църква. След като е била извършена последната реставрация на интериора Старорусский Лъв и Архиепископ Новгород освятили храм на 10 март 2001 година. В този момент църквата се възражда като обителта на Свето-Гергьовден манастир.