Музеят е с официално наименование – Музей на жертвите на геноцида, но при именуване на музея в ежедневието на речта, както и при извършване на пътуване из града Вильнюсу най-често се използва името на Музея на КГБ.

Музеят е открит на 14 октомври 1992 година със заповед на Министъра на просвещението и културата, както и на президента на съюза на политически изселниците и затворници. Музеят е помещава в сграда, в която съветската репресивна структура - НКГБ-МГБ-КГБ и НКВД са били разположени по средата на 1940-те години и до август 1991 година. Организация на данните, ангажирани в изготвяне на планове арести или връзки жителите на Литва, осъществявали преследовательскую дейността на дисиденти, както и всички начини подавляли всички предприети народ стремеж към опит за възстановяване на изгубената независимост.

Освен това, за литовския народ тази сграда служи за символ на съветската окупация на Литва, която се случи на 50 години. По тази причина за литовците много важно, че именно на това място е намерил своето място Музей на жертвите на геноцида, който трябва и ще напомня на сегашното и бъдещето поколение за толкова трагични и тежки години за целия народ (1940-1990 г.). Музей сам по себе си е уникален с това, че е единственият по рода си в така наречените бивши републики на СССР, който е бил отворен, там, където по-рано преди това е било разположено главното управление на КГБ.

До 1997 г. музеят е променена. Права на основателите на този музей са предадени на Центъра за изследвания на геноцида и резистенции жителите на Литва (ЦИГРЖЛ) в съответствие с правителствена наредба на Литовската Република от 24 март 1997 година. Решението носи името: "За предаване на Центъра за изследвания на репресии и Музея на жертвите на геноцида и резистенции жителите на Литва".

В момента музеят е част звено от Паметника на департамента по Центъра. Неговата задача е събиране, съхранение, проучване и развитие на историческо-документални материали, които отразяват методи и форми не само физически, но и духовен геноцид литовски жители, която се проведе съветския оккупационным режим. Освен това, се разглежда големината и начини на съпротива оккупационному режим.

Музейната експозиция е публикуван в тази сграда, която се превърна в символ на страдание и тъга за огромен брой литовски жители, където през 1940-1990 г. е била седалище на КГБ. Зад ъгъла на обикновен градски сградата е разположена в затвор. Всеки ден в нея стотици политически затворници са били изложени на най-тежките истязаниям, както и приговаривались на смъртното наказание, която се проведе на същото място.

В работата на Музея има място на изложбата: Литва през 1940 и 1941 година. В същото време започват репресии. През 1940 г. съветските войски нахлуват в литовскую територия. Страната е изпълнен оппозиционно настроени хора. Именно поради тази причина най-първата стъпка на съветската власт е създаването на институции, онези проблеми на несъгласие в тази страна. В този момент наказателни органи на НКВД вече са натрупали достатъчно богат опит в борбата с недоволни истински съветския режим граждани. Само през месец юли 1940 година повече от петстотин литовски патриоти, бивши представители на властите и интелектуалци са били изложени на ареста.

Посетителите на музея могат да разгледат 19 бивши камери, изолатор в 3 квадратни метра, както и три камери за изтезания. Камери са в сурово състояние и съвсем не отапливались. Освен това, в една и съща клетка на 9 кв. метра, веднага се помещаваше до двадесет затворници, на които е строго забранено не само да седи и да се лежи, но и да си затварят очите. Изтезания камера бяха облицовани в естествена специален зкуконепроницаемым материал, който се изразява с гръмки викове на жертвите, които нанесли тежко удари истязатели. Но най-страшното беше, че хората, на които беше забранено да се спи на тъмно и да седи само в пълна изолация, започнали да губят ориентация в пространството и просто е луд. Подове на така наречените "мокри" фотоапарат заливались студена вода, при това, затворници да стоят на дискове от метал, не дава спасть им на електронен носител).

В музея работят екскурзоводи, които са били в миналото политзаключенными. Всеки водач винаги показва своята камера.