Средновековна сграда на манастира Санта Мария де Алкобаса се намира в централната част на град Алкобаса. Градът е получил името си в чест на реки Алкоа и Бас, на мястото на сливането на които той се намира.

Манастирът е основан първият крал на Португалия, Афонсо Энрикеш, през 1153 година. Църквата и манастира са били най-първите сгради в Португалия, построен в готически стил, и се считат за важни исторически паметници от епохата на средновековието. През 1989 г. от ЮНЕСКО е направил манастирът Санта Мария де Алкобаса в списъка на обектите на Световното наследство.

Манастирът е един от първите храмове монашеского на ордена на цистерцианцев в Португалия и е построен при крал на Португалия Афонсо Энрикеше в чест на победата му над маврите. Строителството на манастира е било част от стратегията на цар, който искал да се засили доверието в ново създадената империя и насърчаване на колонизация на земята, наскоро отвоеванных от маврите.

В момента строителството на манастира, в 1178 г., монаси от ордена на цистерцианцев вече са били в града за повече от 25 години. През цялото това време те са живели в дървени къщи, а в манастир и се премества в 1223 година. Църквата е завършена много по-късно и се счита за най-голямата църква в Португалия. Последен щрих в този ансамбъл е покрита галерия Силенсиу (галерия Мълчание) в готически стил, която е била построена през XIII век.

Библиотека в Алкобаса се счита за една от най-големите библиотеки в епохата на средновековието в Португалия. В 1810 г., по време на френското нашествие много книги са били откраднати. Останалата част от книгите днес се съхранява в Националната библиотека на Лисабон.

По време на царуването на крал Мануел I е довършен втори етаж над покритата галерия Силенсиу и построена в ризница стил мануэлино. Манастирът е още по-разширена през XVIII век изграждането на нова покрита галерии и кули на църквата бе обновена фасадата е в духа на барока. Вътре в църквата се намират гробниците на Дон Педро I и Доны Инеш де Каштру, изпълнена в готически стил, и са великолепни примери на изкуството Португалия XIV век.