Музей на Авейро е основан през 1911 година и се намира в историческа сграда на бившия доминикански манастир на Исус. Манастирът е построен през 1458 година. Фасада на сградата, която виждаме днес, датира от XVIII век. Жилищната сграда е с три входа с красиви покриви, както и централния фронтон на сградата е украсена с кралския герб. В близост до входа на паметника на Свети Жуане (Йоан).

Атриум е бивш манастир, сега се използва като вестибюл на музея. Запазена къща capitulum, където са се провеждали събрания, и църквата, която датира от XV век, с колони в стил Ренесанс, както и множество параклиси в стил мануэлино, декорирани с плочки "азулезуш". Интериор на главната капела на църквата красят работа от дърво с позлатени XVI век. Стените са украсени с плочки "азулезуш", на която са изобразени сцени от живота на Свети Жуаны, също висят картини, в които показва тази бърлога.

В дъното на параклиса, където ви служи литургия, струва гробницата, в която почива праха на принцеса Жуаны, дъщеря на крал Афонсу V. Гробницата започна да се изгради по заповед на крал Педро II, но пръстта принцеса там се премества само в 1711 година. Гробницата е украсена с разноцветни мозайки, изработени от италиански мрамор. Всяка страна на гробницата е украсена с картини изобразяващи сцени от живота на принцесата, таван капела е изпълнен в стил барок. Над проектирането на гробницата е работил кралския архитект Мануел Антунеш.

Принцеса Жуан е приела монашески постриг в 1472г. и живееше в този манастир чак до смъртта си през 1489 година. Тя е била известна със своята добродетел, и, според легендата, с нея са свързани някои чудеса. В 1673 я причислили към лику на светиите като Светата Жуану.

Музеят притежава богата колекция от картини, скулптури, цветни плочки, мебели, керамични изделия от епохата на барока.