През 1444 г. в покрайнините на града Боровска, Kaluzhskaya област, на най-вискоко място, където реката Истрема се влива в река Протву, е основана мъжки Пафнутьево-Buba манастир. Манастирът, кръстен на своя основател – игумен Пафнутия.

През 1467 г., вместо дървена църква е построена белокаменный катедрала, наречена Коледа. Впоследствие църквата не е запазен. Храм Рождество Богородично е известен с това, че стенописи, които той е украсен – това бяха едни от първите произведения на великия лв Дионисий. Всички стенописи на Дионис са обработени под ръководството на стареца Симонов манастир, иконника Митрофана.

В 1586 г., в годините на царуването на цар Фьодор Иванович, катедралата е разглобен и на негово място е издигнат нов пет начело. Материал за изграждане на основите на новата катедрала служи бяла блокове с стенописи лв на Дионис на XV век. По този начин, откъси от произведения лв Дионис и иконника Митрофана са запазени до наши дни и се съхранява в Боровском клон на Калужского държава регионални регионалния музей и в Централния музей на старинна култура и изкуство. Андрей Rublev в Москва.

През XVI век манастирът огородили каменни стени, жилището е станал служи на гранична крепост. В същия век бил издигнат храм в името на Рождество Христово с каменна стол. През 1523 година е построена камбанария, а през 1688 г. го заменили камбанария.

Стени и кули Пафнутьево-Боровской жилището се отнасят към сгради от XVI—XVII векове. Съществува версия, че св. георги, Оръжейната и Готварска кула на манастира са били създадени под ръководството на известния архитект, автор на съоръжения Белия град в Москва и Смоленск на кремъл и Симонов манастир, Фьодор Савельевича Кон. Въпреки това, специалистите на нашето време твърдят, че стените Пафнутьево-Боровского на манастира и най-древната кръгла кула, която е запазена до наши дни, са били построени, след издигането на църквата и на камбанарията същия зодчим. Останалата част от кулата: Тайницкая, Джордж са били възстановени след прекратяване на манастира по време на лошият време в 1635 г. от майстор Трофимом Шарутиным, както и най-новите кули: "Стражева и Входна восстанавливались в 1636 г. или след. Трябва да се отбележи, че планът на крепостта е била предназначена за защита на подови "приступной" на стената, което е типично за XIV-XV векове, т.до. кули, построени на малко разстояние един от друг, по линия на подови страна на крепостта са изчислени на активното съпротивление и едновременно с изпълнението на архитектурна функция на централната фасада на манастира.

През 1610 година от поляците манастир, гоце княз Михаил Волконский, но той е бил превзет и изгорен.

В периода на реформата на патриарх Никон епископ Павел Коломна, йеромонах Полиект Buba и някои други от мениджърите на манастира се обявиха срещу църковните реформи. Впоследствие противниците на реформата са били подложени на репресии, а епископ Павел Коломна и йеромонах Полиект Buba са били екзекутирани.

След реформите, проведени патриарх Никоном, Пафнутьево-Buba манастир се превърна в запада. При правлении на Екатерина II в манастира оставили 33 монах и послушника, а почти всички притежавани Пафнутьево-Боровскому имоти на манастира са били отнети. През 1812 г. французите били изгорени манастир, но след пожар през него успя да се възстанови.

През 1923 г. за имот, собственост на Пафнутьево-Боровскому манастира прехвърля в ръководството на Главмузею, но скоро в него беше публикуван исправительная колония, а след това – сельхозтехникум. През 1960-те години, при реставрационни работи е установено 194 бял камък блок, и е само на 29-ти са запазени фрагменти снимков материал декоративна живопис, датирующиеся началото на XVI век.

През 1991 г. манастирът предадоха на Руската Православна църква, а през март същата година той беше открит. Мощите на преподобния Пафнутия Боровского, основател на манастира, се съхраняват в Рождественском катедралата.