През 1953 г. критски Общество исторически изследвания е основан на Историческия музей на Крит. Настаняване на музея в сграда в нео-класически, която е построена през 1903 г. и е принадлежала на семейството Калокеринос. През 1952 г. Андреас Калокеринос предава сграда в Обществото на исторически изследвания за създаване на музей.

Експозицията, представена в музея, обхваща голям период от време, започвайки от раннохристиянски времена на Крит и до наши дни. Основната цел на основателите на музея е да събере и за запазване на ценните археологически, етнографски и исторически материал. В колекцията на музея постепенно е бил обогатен, разширява и самият музей (към основната сграда е пристроено ново крило в съвременен стил). Музеят се занимава с изследователска и издателска дейност, провежда и временни изложби и различни образователни програми.

Разглеждане на музея започва от залата А. Калокериноса, в който е представена гледане на изложбата за историята на остров Крит. Основен експонат в тази зала е модел на града Ираклион средата на 17 век (връх на популярността на венецианското могъщество) с размери 4х4 метра. Нататък обширни колекции на музея са представени в хронологичен ред и по категории. Експозицията на музея включва и керамика, скулптури, бижута, стенни картини, гравюри, преносими икони, ръкописи, ритуални предмети, оръжия и много други. Отделно от това е да се осигури богата нумизматическую колекция, в която са представени монети, банкноти, медали, печат и архивни документи, отразяващи всички етапи на критски икономическа история от раннохристиянския период и до 20-ти век.

Перли на колекцията на музея има две картини на известния художник Ел Греко "на Гледката към планината Синай и Манастира Св. Екатерина" (1570) и "Кръщението на Христос (1567). Това са единствените творби на художника, изложени в Крит.

Особен интерес представлява експозиция, посветена на живота и творчеството на известния гръцки писател Никоса Казандзакис, която включва лични вещи, ръкописи и първите издания на негови творби на различни езици. Е добре осветена и съвременната история на Крит, с особен акцент върху революционните събития от 19 век и Втората Световна Война. Етнографска колекция на музея се срещне посетителите с бита и традициите на жителите на остров Крит. В този раздел е представен обновеният интериор на селски къщи.

В библиотеката на Историческия музей се съхраняват редки издания, периодика, архив на местния вестник, богата колекция от исторически архиви и фотоматериалы. Библиотека има за цел както на широката общественост, така и за изследователи.