Флоровски манастир за първи път се споменава в документи от XVI век, най-малко именно в 1566 г. е издадена диплома на княз Константин Острожскому, според която на територията на манастира се предаваше протопопу Якова Гулькевичу, който и възобновява дейността на манастира (това означава, че той е съществувал и по-рано). В 1682 г. вече се среща споменава за това, че Хем беше момичешки манастир с две църкви, една от които носеше името на мъченик Флора.

Обаче, от момента на възобновяване на дейността на манастира до началото на XVIII век у Флоровского на манастира е било трудно с финансите, така че той почти не се развива. Само в 1712 г., след приключването на женски манастира и превод живели там монахини по Флоровски манастир започва разцвета на манастира, тъй като всички владения на затворените манастира са преминали в собственост на Флоровского.

Не след дълго превод монахини по Флоровском манастира започват да се издигне на нова, вече каменна църква Възнесение господне. След освещаването на храма, през 1732 г. манастирът започва официално да се нарича Свето-Вознесенским Флоровским. Освен този храм всичко останало е дървена, така че сумата в известния киевски рус 1811 година. През следващата година от касата бяха отпуснати средства за възстановяване на манастира, които били издигнати каменни сгради. До началото на ХХ век, вече цялата територия на манастира е изградена с каменни и дървени постройки (болница, богадельней и още множество храмове).

В годините на съветската власт манастир затвори, унищожавайки при храм "Света Троица". Възраждането на манастира започва само по време на немската окупация, и въпреки че впоследствие Киев е бил освободен, жилището вече не се затваряше, макар и да продължава да устоявате на тормоз от страна на властите. Към днешна дата той продължава да се развива и развива традициите на духовността.