Град Коимбра, разположен на хълм, е третият по значение град в Португалия. Тя се нарича още стария университетски град, тъй като в него се намира един от най-старите университети в Европа. Университет е основан през XIII век и първоначално се е намирал в Лисабон. Но поради лоша организация на функциониране в 1537 г. от университета е бил преместен в Коимбру.

Библиотека Жуанина се намира в Коимбрском университета, в непосредствена близост до университетската кула и е кръстен в чест на португалския крал Жоао V, по време на управлението на който и да е построена и сграда на библиотеката. Сградата е построена през XVIII век. Над входа в библиотеката виси национален герб. Библиотеката се намира в горната част на университета, и се състои от три зали: червено, синьо и зехтин, които са разделени с декоративни арки. Във всяка зала са двуетажни книжарниците почти под най-таван. Стени библиотеки са много дебели, а вратите са изработени от дърво и тиково дърво, което помага за запазване на определена температура вътре, за да не заводились насекоми в дъбови рафтовете на книжарниците.

В елементите на декоративен детайл на интериора на библиотеката ярко изразен стил барок, отличителна черта, която е в изобилие на златни детайли. Маси изработени от розово и эбенового дърво, а мъжкото книги, както и кожена тапицерия на седалката и кожени тапети са запазени от основаването на библиотеката. Мебелите в залите, изработена от екзотична дървесина, покрита с позлатени.

В библиотеката се съхранява голяма колекция от книги, която активно се използва както от студенти, така и преподаватели от университета. Сред тази колекция има и редки екземпляри, като една от 20 древнеиудейских Библии, която оцеля по време на инквизицията.

През 1901 библиотека е преименувана в Централната библиотека на университета, тъй като в факултети са създадени си библиотека. През 1962 г. е построена още една сграда на библиотеката, оснащеннок модерни технологии, където се съхранява още над един милион копия на книги.