Православен храм " св. Николай Чудотворец е основан в Лион представители на руската общност, които са емигрирали от Франция след революцията от 1917 г..

Първият храм, основан през 1928 г., се помещава в една дървена сграда на улица Барабан. Той е кръстен на известния светец, а така също и като спомен за расстрелянном заедно със семейството си в император на Николае Втория. За първи настоятел на храма става баща Виктор (Пушкин), бивш полкови свещеник.

През 1937 г. храм, най-вероятно, защото за палеж, е изгоряло напълно. Неговото възстановяване е започнало само две години по-късно – за изграждане на каменната сграда избрали ново място на улица Сент-Женевиев. Храмът, изградена по проект на емигрант Сергей Баздерева. Изграждането на храм извършена от силите на настоятеля и членове на събраните дарения, на работа са се водили вечер и в почивните дни, така че изграждането достигне много бавно. Дори по време на Втората световна война, въпреки бомбардировките и недостиг на средства, работата продължава. А интериорът на храма е продължило още и в следвоенния период. Освещаването на храма се състоя през май 1946 година.

През 1970-те години в храма след рухването на тавана се проведе ремонт. Близо до края на миналия век, около храма са се увеличили жилищни квартали, а когато до него е открита спирка на метрото, брой поклонници се е увеличил. Една от иконите на храма посветен на светеца Иринею Лионскому – епископ на Лион, които взеха бил убит смърт за вярата в 202 година.

Храм "св. Николай Чудотворец" в Лион, не се различава богат на интериора и оригинална архитектура, обаче го наричат паметник на първата вълна на емиграция и символ на любов към православната вяра.

В Лион има и други руски православни храмове – например, църквата " Св. Йоан Руски.