Нагасаки е появил в края на XVI век като малка част от пристанище селище, след това се превърна в града, който през следващите два и половина века е бил единственият порт, отворени за международната търговия. Към края на XVII век Нагасаки се превърна в един от най-големите в Япония мисионерски центрове, а в момента в него живее най-голямата християнска общност в страната.

За тези и други факти от историята на града може да научите, като посетите музей на историята и културата на Нагасаки. Той е открит през 2005 г. на бившата резиденция на управителя Нагасаки. Сградата се отнася към сгради средновековния период, тя преживява пълна реконструкция. В годините на Втората Световна война в тази сграда се заселват в щаба на ПВО Нагасаки. В приют, който се намира в западната част на сградата, по време на атомна бомбардировка са се опитали да се скрият в градовете.

Колекция на музея включва 48 хиляди единици за съхранение на багаж, сред които документи, произведения на декоративно-приложното изкуство, както и предмети, донесени в Япония от чуждестранни търговци. Експозицията на музея в по-голямата си част посветени на темата за международни отношения и контакти на Япония с други държави в периода на самостоятелно изолация, охватывавший от XVII-XIX век. По-специално, постоянна експозиция представя експонати, внесени от Холандия, Китай и Корея. В музея също така можете да получите представа за така наречената култура Нанбан или култура "на южните варвари" - имигрантите от Португалия и Испания. Освен това, част от музейната колекция е посветена на проникването и разпространението на християнството.

Пространството на музея е разделено на три части, едната от които е добивана тема магистрат Нагасаки и съдържа реконструкция на живот служители на средните векове. Другите Две части са посветени на историческа култура и съвременния начин на живот Нагасаки – за това, какво място заема градът в икономиката на страната и в какви сфери на заема водеща позиция.