Първият университет в Пече се появи в 1367 г. като една от най-старите в Централна Европа крал Луи Велики, тя отиде под по време на турската окупация. През 1921 г. от бившия Унгарски университет в Братислава (него. Братиславу, унгарски : Пожонь ) се премества в Печ, това результатом1982 " Янус Паннониус университет ( Janus Паннониус Tudományegyetem, JPTE ).

Първият университет в Пече създаден от Луи I на Унгария през 1367. Просуществовав като единен образователен център няколко десетилетия, в средата на 15 век, той е разделен на две училища - право и теология. По време на турската окупация на университета е затворен и е отворил врати едва през 1785 г., когато Йосиф II прехвърлени Кралската Академия от Дьера в Печ. В 1802 г. Кралската Академия се върна в Дьор по заповед на Франсоа I, и институциите на висшето образование в Пече не е до 1833 г., когато епископ на град Печ под егидата на градския сенат основана през Пече Академия с отделите по право и философия.

Модерен университет на град Печ е основан през 1912 г. и първоначално се е намирал в Пожонь (сегашната Братислава). След Първата световна война Пожонь е анексирован от Унгария, а през 1921 година университет се премества в Печ, където тя остава и до ден днешен. През 1951 г. медицински факултет на университета е отделен, и до 2000 г. е отделна институция. През 1982 г. университетът получи име Янус Паннониуса. Истински университета в град Печ е създаден на 1 януари 2000 година, чрез сливането университет Янус Паннониуса, Медицински университет град и педагогически колеж.