Джамията Байракли Джамия – една от най-старите градски сгради в Самокове. Разположен в близост до централния площад на града, в близост до автогарата. "Bayrak" от турски, ще бъде правилно да се преведе като "флаг", а "Bayrakli" – това вече ще бъде "флаг". Археолозите предполагат, че сградата на джамията е построена от фрагменти по-древна джамия от XVI век. Горната част на строежа е направена от дърво, по – голямата част камък.

Дата на построяване Байракли Джамия – 1840 година, в навечерието на освобождението на България от османско иго. Във връзка с това събитие, се радват на джамия по предназначение съвсем за кратко. Въпреки това джамията е живо напомняне за пятивековой властта на турците. Самоков е бил заловен в 1371 г., но градът остава добре развито целия период на окупация и дори се превърна в център на железодобывающей специализация сред всички европейски провинции, собственост на турците трябва да изградим.

На входа на джамията е украсена с колони от дърво, които се вписват в фасада с фрески. Всичко това създава илюзията за сцената в театъра. Такива архитектурни решения са ярки примери за майсторството самоковских художници, които с лекота може да излезе извън рамките на традиционната живопис.

Тъй като националното възраждане на България като веднъж падна на XVIII век, това е отразено и в строежа на джамия. Типично за българския "народен" стил са се превърнали ротондата, която е увенчан с купол, покрит с керемиди червен цвят. Корнизи отвън и вътре са орнаменти с преобладаващи флорални мотиви. Подобни стенописи може да се види в самоковских православни храмове и дори в градската синагога. Рисувани вътре в джамията се отличава с уникална комбинация от традиционни стилове: европейската рококо и барок. Може би бърка джамия и християнска църква неопитен паломнику би било просто, ако няма минаре.

От 1920 г., джамията е затворена и обявена за паметник на културата от национално ниво. След реставрация на сградата на джамията превърната в музей.