Църква Сан Педро де Атакама се намира на едноименния площад на едноименния град. Тя е важна архитектурна атракция на града и една от най-старите църкви в страната.

Има документи, които свидетелстват, че през 1557 г. на това място е била параклис, в която е служил свещеник Дон Кристобал Диас де лос Сантос. Сегашната църква е построена на мястото на параклиса, датируемой 1745 година. Като 41 м дължина и 7, 5 м широчина, църквата на Сан Педро де Атакама прилича на огромен кораб, по удивителен начин очутившийся в пустинята Атакама. В църквата е просторна, трикорабна, трансепт и елегантни сводести арки. Олтара на църквата, може би, единственият по рода си в Чили, изпълнена в стил барок и е разделен на колони на три части с ниши.

От запад на църквата се е намирала камбанария с четири камбани, построена през 1782 година. Но през 1860 г. кулата е била разрушена. В края на XIX век на това място е била построена дървена камбанария, която заменя на скалната през 1964 г., по време на редовното реконструкция на църквата.

Основният материал, който е използван при изграждането на църквата, камък и варовик. Олтара и арки, издълбани на камък. Покривът е покрит със слама, а стените обмазаны вар разтвор.

Църквата на Сан Педро-Атакама е обявена за национален паметник на Чили през 1951 година.