Сградата на синагогата в Томар се смята за един от най-добре запазените в Португалия подобни сгради, строени в епохата на средновековието. Синагога намира се в историческия център на града. Заслужава да се отбележи фактът, че в синагогата, се намира малък еврейски музей, който привлича огромен брой туристи.

Синагога Томара е построен в средата на XV век еврейската общност в града. Ако разгледаме сградата отвън, а след това синагога не се откроява сред други къщи на улицата. Модерен централен вход в синагогата е построена по-късно и излиза на северната част на улицата. В средновековието главният вход е изпълнена под формата на стрельчатой на готическата арка и се излиза в източната част на улица, по посока на Йерусалим.

Чрез въвеждане на посетителите попадат в квадратен хол. Три страничните кораби са разделени от четири колони, които поддържат сводест таван в готически стил. Капители на колони, украсени с геометрични и растителни орнаменти. При разкопки зад сградата на синагогата са открити останки от миквы, ритуална басейна, предвиден еврейските закони.

През 1496 г., когато са били гоненията на евреите, живеещи в Португалия, в синагогата се намираше в затвор. По-късно там е имало църква, а след намирал склад. През 30-те години на ХХ век историческа сграда на синагогата е закупен полски учен Самуэлем Шварцем. Той беше възстановил сграда и го дарява португалски правителството с това условие, че в него ще се отвори музей. През 1939 г. в синагогата откри еврейски музей на Абрахам Закуто, който е известен астроном в средновековието. Сред експонатите на музея на средновековните надгробни плочи. Един от най-известните експонати смята се каменна плоча, която датира от 1308 година, доведен от синагогата Лисабон.