Последните два века от Свето-Духовский манастир е единственият по рода си на православен храм, намиращ се в Вилнюс. Храмът е кръстен в чест на Сошествия апостоли Светия Дух и е най-важният паметник на архитектурата и историята на Литва. Той се намира в близост до Остра брахма в Стария град. Светият храм съхранява в себе си нетленни мощи на великите мъченици Evstafiya, Йоан и Антония.

Както е известно, през 1596 г. е била затворена Брест уния, която предполагаше асоциация на Полша и Литва в единна държава. Настъпват трудни времена за православни вярващи – затвори всички църкви в Вильне, а Свято-Троицкий манастирът е преминал в ръцете на униатам.

В тази ситуация хората яростно се бореше за връщане на православната църква. Получаване на постоянни откази, вярващите не ще се предадат, и в 1597 г. е получено разрешение от Сигизмунд III на изграждането на нова православна църква срещу "света Троица" на манастира. Църквата е построена върху земя, която е принадлежала на Дорофее-Анна и Теодор, а по-късно тя е прехвърлена в собственост на Свето-Троицкому братство. С това време братството стана носят името на Св Духовское, а към храма са пристроены типография, изключение и училище. Именно този храм е станал представител на православната вяра в Вильне.

Построен при храма училище се състои от няколко класа. Специално за студенти е публикувана "Словенская граматика", както и "Речник". Именно по него, учих не една хиляда души, а на специална гордост на храма се смята за факт, че в училище се занимавали Михаил Ломоносов.

През 1634 г. крал Владислав Мога да допълнят описание