Манастир св. Йоан Кръстител - един от най-забележителните храмове в град Новосибирск и любимо място за поклонение на много православни.

Историята на манастира започва през 1993 година, когато една вярва меценатка решава да изгради в близост до гробището храм в памет на починалия си син. Изграждането на храма се състоя достатъчно бързо и в същата година се проведе тържествено осветена в чест на св. Евгения. След известно време в манастира са станали съезжаться хора от цялата страна, които желаят да посветят живота си на монашеству и на Бога. През октомври 1999 г. Свещения Синод на Руската Православна Църква прие решение за създаване на мъжки манастир на свети мъченик Евгений в Новосибирск.

През 2001 г. в нововозведенный храма на Архистратига Михаила се премества манастир от Заельцовского пространство и получил парче земя близо до храма, където започна строителството на сгради, необходими за манастира. Храмът на Архистратига Михаил", основан през 1996 г. е построена през 1999 г. обаче довършителните работи продължават, още преди 2003 г. Тухлена сграда на храма, изпълнени в български архитектурен стил и се състои от главен восьмигранного обем, увенчан глава и камбанария, разположена под луковичным купол. В храма също така са с блестящо злато куполи и кръстове.

През 2001 г., за манастира се разпределят допълнителен парцел близо до храма. През 2004 г. е издигнат братски корпус. През 2000-те години, също са били построени манастирска стена с кули. През януари 2007 г. се състоя тържественото освещаване и вдигане на основния камбани на храма, с тегло 600 кг., През март 2007 г. от мъжки манастир в чест на св. мъченик Евгений преименуван в епархиальный мъжки манастир в чест на св. Йоан Кръстител.

В момента в манастира има два храма: голям - в чест на Архистратига Михаила, и малък - в името на Рождество на Йоан Кръстител. На територията на манастира, също може да се види тухлена водосвятную параклис Икона на Божията Майка Живоносный Източник, построена през 2007 г. С мъжки манастир работи детски и за възрастни неделно училище.