Военни гарнизони, защищавшие манастир по време на полско-литовската обсада 1608-1610 години, се настаняват в близост до западната страна лаврите и образуват Стрелецкую и Пушкарскую селища. Усилията на жителите на тези земи към 1645 г. тук се появява дървена църква в чест на Казанската икона на Божията Майка. В храма се освещава параклис в чест на Илия, Пророка, в името на чийто основател на манастира Дина Шнайдерман се опита да създаде църква, но при живота, той не е успял.

През 1727 г. Ильинский свободно се отделят от Казанския храм и изграждат наново наблизо вече отделна църква. Но след деветнадесет години е имало пожар, който е напълно унищожени двете сгради. След една година енориашите Ильинскую църква възстановяват, а на мястото на Казанската се появява параклис, простоявшая тук пет години. През 1752 г., вместо на параклис отново изправени Казански храм, просуществовавший до средата на XX век. Сега църквата на Казанската Богородица не съществува.

През 1958 г. обветшавший храм решено да се разглобява, а на негово място се установи кръст. Той напомня за това, че тук е имало доста рядко ярусное конструкция. Най-високата дървена нарязан четверик е бил в основата на пирамидата от три восьмериков. Розово отвън, храм с золочеными кръст и глава вътре просматривался цялата височина. Държавата на купола е умело расписан лаврским господар и пазач Ильинского храма Малышевым Иван Матвеевичем, а иконостаси изпълнени от неговия син Константин.

Църквата Пророк Илия не само се е запазила до наше време, но и се превръща в единствената в Сергиевом Посад, която е действала в съветско време. Каменна тя стана, като се започне с 60-те години на XVIII век. Тухла, за църквата са взимали в манастира олифленном двор. В 1773 г. лаврский йеромонах Павел проведе ритуал на посвещаването на храма на пророк Илия и го придела в чест на Дмитрий Ростов. Параклис в името на Иверской икони на Дева мария се появи тук след още един век, през 1878 година.

Три обема, разположени по една ос и характерните за много църкви Сергиева Посада, образуват и Ильинский храм. До кубическому четверику долепена от изток - висока полукръгла апсида, от запад — широка трапезария с трехъярусной камбанария. Фигура на покрив на ядрото на силата на звука носи двухчастный барабан с малка глава. Стил барок, в която е изпълнено външно украсата на църквата, тук се проявява в целия си блясък. Богато украсени варосани апликации множество прозорци са разпределени на червен фон на стените. Допълват фасади портали, сдвоенные пиластри и широки стрехи. Сводовете и стените на интериора Ильинского на храма е рисувал Иван Малышев, както и този господар е направен и пятиярусный позлатени иконостас. През 1890-те години на църквата придобива още две пристройки: помещение на библиотеката и фурната.

През 1946 г., за Успение църквата Троица Сергиеви лаврите Илия църквата е жертвала някои издания от неговата библиотека и предмети, църковна утвар, както и в манастирския храм се премества един от енорийски хорове. През втората половина на XX век църквата на Илия, Пророка, се превърна в архитектурен паметник от национално значение и е взета от държавата под охрана. Сега при храма действа неделно училище и енорийска библиотека.