Археологическият музей на град Ханя и разположен в сградата на бивш венециански на Катедралата "Св. Франциск" в центъра на стария град на улицата Халидон. Музеят е основан през 1962 година. Артефакти, изложени в музея, да дадат на посетителите добра представа за развитието на историята на западен Крит от епохата на неолита до римско време.

Когато е построена и сграда автентично, не е известно, въпреки че са english свидетелство за голямото земетресение 1595 г., в които се споменава и църквата " Св. Франциск. Днес сградата на музея е важен исторически паметник на града. В периода на османското владичество църква перестроили в джамията, и наречен в чест на Юсуф Паша, завоевателя на Ханя. В началото На 19-20 века в сградата се помещава кино "Идеон Ddttmm". След Втората Световна Война чак до 1962 г. (когато сградата е била прехвърлена Археологическому музея) тук се е намирал склад на военна техника. Археологическата колекция на Ханя по-рано се помещава в различни обществени институции (Администрация, Гимназия за момчета, джамията Хасан).

В музея се събират впечатляваща колекция минойских и римски артефакти, събрани от археологически разкопки на град Ханя и на целия регион. Експозицията на музея е представена в хронологичен ред и включва керамика, скулптури, статуетки, оръжия, златни накити, печати, монети, саркофазите и други погребални предмети, мозайка, глинени плочки с надписи и др.

Сред огромното разнообразие на музейната експозиция е да се осигури на римския подова мозайка с изображение на Дионис и Ариадны (2-3 век крумовград). Важно място в колекцията на музея са глинени плочки с линейна надписи по тях (1450 – 1300 г. пр. хр). Интересно е рисувана саркофаг (1400-1200 г. пр. хр) от минойската акропола Армения и бюст на римския император Адриан.

През 2000 г. Константин и Teodora Митсотакисы предадоха дар на Археологическому музея на град Ханя огромна частна колекция от семейството си, което е една трета от цялата експозиция на музея, и е богата на редки исторически реликви.

Посещение на Археологическия музей на град Ханя, може да се потопите в атмосферата на древния град, да проследим как са се променили начин на живот и традиции на жителите на западен Крит, като усовершенствовались техните знания и умения.